GENOMICS / ONCOPRINT + OPTIONAL CLINICAL ANNOTATIONS
带临床注释的突变瀑布图 OncoPrint with optional clinical annotations
核心展示样本突变负荷、基因×样本突变矩阵和基因突变频率;除前三个固定字段外,其余任意列都会识别为临床注释。用户提供的 TCGA 参考数据 · 浏览器本地处理
这张图怎么读队列中的样本突变负荷、高频突变和共现模式如何?
- 中央矩阵
- 基因×样本中的突变类型,可显示同格多突变
- 顶部柱
- 每个样本的突变记录数
- 右侧柱与百分比
- 携带该基因突变的样本比例
- 可选底部色带
- 仅在上传对应列时显示 Stage_T、Stage、Gender、Age 等临床注释
可用于肿瘤队列突变景观 · 靶向基因 panel 汇总 · 基因组与临床特征联合展示
突变频率与共现属于描述性结果;不能仅凭图形判断驱动作用、预后效应或因果关系。
OncoPrint 瀑布排序 + 描述性突变矩阵样本全集取自所有输入行;基因、突变类型、突变负荷和矩阵标记只使用 gene 与 mutation_type 均已填写的真实突变记录。临床注释不参与核心计算。默认按基因突变存在模式进行 OncoPrint 瀑布排序。