SINGLE CELL / UMAP + COMPOSITION
单细胞 UMAP 与细胞组成图 Single-cell UMAP and composition
三列即可绘制预计算 UMAP;补充 Lineage 与样本编号后,可同时生成细胞组成面板。正在生成演示数据
这张图怎么读已经计算好的 UMAP 中,不同细胞亚群如何分布?
- 横向位置
- 预计算的 UMAP1 坐标
- 纵向位置
- 预计算的 UMAP2 坐标
- 颜色与标签
- cell_type 细胞亚群
可用于单细胞聚类结果展示 · 细胞亚群注释检查 · UMAP 图形排版
该页面不计算 UMAP;二维距离和局部邻近也不能直接解释为谱系或发育关系。
预计算 UMAP 坐标映射页面直接映射上传文件中的二维坐标,不执行标准化、PCA、邻居图或 UMAP 计算。数据超过显示上限时,只对可见点做确定性分层抽样。